医源远流长，发展至今，苗家医药已经有三、四千年的历史。苗族的医药常常与神秘、神奇这样的词汇联系在一起，自成体系，尤以其内病外治的疗法闻名中外，成为民族医药的一枝奇葩。苗族民间还有“千年苗医，万年苗药”之说。有神农“尝百草、识药效，除病痛，始创医学”；“蚩尤传神药、医治百病”；“祝融传熟食，传按摩强身健体术”；“欢究传丹砂、消疫除瘟”；“苗父药到病除，神传疾解”；“药王餐风露宿寻找药方，传承‘三千苗药，八百单方’”的苗医远古原始医药历史。
苗族人民在长期的生产活动和与疾病、伤害作斗争的实践中，积累了丰富的、宝贵的医疗经验，成为我国传统医药宝库中的一部分。苗医对病因的认知和对疾病的命名、分类等，皆具有浓厚的民族特色。

       黔东南苗医主要哲学思想是在一分为二指导下的医学基础，有“两纲”、“五经”、“三十六症”、“七十二疾”之说。如两纲即冷病、热病；两种药性，即冷药，热药；病因分为两因，即内损和外因；治疗原则分为冷病热药治，热病冷药治。在人体物质结构上，认为气（苯）、（象）、水(沃）是重要组成部分。人的生、老、病、死与气、血、水有密切关系。在治疗方法上，有内治法和外治法。苗医外治法大体上分为七大类：针类有瓦针、温针、油针、硫磺针、糖药针、植物刺针疗法；灸类有药灸、姜灸、蒜灸、盐灸、辣椒灸、火酒灸、鹿麻灸、烧灯火、烧药火等灸法；拔筒类有火拔筒、纸媒筒、气角筒等；推擦类有推拿、按摩、拍水、拍醋、拍酒、滚蛋、刮铜钱、刮脊抽腿疗法等，敷熨类有外敷、机贴、热赞、发泡疗法等；熏洗类有熏蒸、烟熏、外洗、沐浴疗法等；放血割脂类有放血、针挑疗法。
       苗医通过望、听、嗅、问、摸、弹等方法搜集疾病表现的各种症状和体征，结合天时地域及其他条件进行综合分析，辨清冷、热二病，分别所属病证，为治疗原则和具体治法提供重要依据。

      苗医用药多是植物药、动物药及少量矿物药。药的特征归纳起来有热、冷和不热不冷三种；热药可治冷病，冷药可治热病，和药可补体质、治亏损病。药物的“结构素质”决定药力及药性：“质粘者易消化，补气力，清头脑；质糯者难消化，强筋生血，易伤肚；质沙者好吃，补血肉，和血脉，较难消化，容易产生多屁；质面者糊口，补肉补气，利关节，较易消化，多食令人胃弱.
       苗医药是苗族在生产生活中的智慧结晶，是千百年来的为苗族繁衍生息做出过巨大贡献的保健医疗技术，更是在实践经验的基础上总结发展起来的生命科学。
它是苗族文化的瑰宝，渗透在苗族人生活习俗的方方面面，反映了苗族人对待天地的自然生命观；
苗医药更是由苗族原创的具有自主产权的医药学体系，有着巨大的、潜在的经济价值，是中华民族中医文化宝库的重要组成部分。
      历史上由于战争迁徙，苗族先民逐渐遗失了古苗文，苗族医药主要依靠家学、口传身授或宗教仪式的方式进行传承。它的诊疗、本草、方药通过历代薪火相传，至今仍有很强临床应用活力。
       特殊的传承方式，使苗医药蒙上神秘的色彩，至今相当多苗族民间药方的特殊功效，难以用已掌握的现代西医理论解释。也是这种原因，苗医药在西医药的冲击下被边缘化，没有得到学术界的重视。如此长期下去，必然造成苗医药人才流失，逐渐衰落。加快苗医药的发展，抢救千百年才形成的苗医药文化，发挥苗医药原创优势、推动我国生命科学实现创新突破，对弘扬中华优秀传统文化、增强民族自信和文化自信，造福人类具有重要意义。